有機肥養分比較全面，肥效穩定、持久，同時還能起到疏松土壤，培肥地力，改良土壤結構，提高作物產量和品質等多種作用，是果樹生產中的一類重要肥料。不過，對于有機肥的施用，不少農友尚存疑慮，這里我們挑重點來說一下。 有機肥的選擇
從原料構成來看，有機肥可分為礦物源有機肥和生物質有機肥。雖然兩者均具有緩效、全面、改土的作用，但側重點略有不同。
礦物源有機肥的原料的前體是動植物殘體千百年礦化而成風化煤、褐煤，在改良土壤團粒結構、提高礦質營養元素利用率方面效用更佳。
生物質有機肥的原料以畜禽糞便及秸稈腐熟為主，富含氨基酸、核酸、多肽、蛋白酶等活性成分，對樹體的調理效用更明顯。因此，土壤退化重的果園用礦物源有機肥更好，土壤情況良好的單施生物質有機肥就行。
下肥時間
沒有硬性規定，但結合土況、樹況來看，落葉果樹以秋季最佳。
一方面，此時果實也采收，正好是樹勢恢復、養分累積的大好時機，而根系也處于生長高峰，斷根后可及時恢復。另一方面，秋季土溫不低，墑情較好，有利于土壤微生物活動，肥效更高。
施用方法
有機肥需開溝施入，且要充分和土壤進行接觸，不然沒有改土作用，還易流失。有機肥的施用位置要靠近吸收根，即樹冠外圍垂直投影處，并適度深施，引根下扎，太近大根不僅不利吸收，還易燒根。施用有機肥時應注意與無機肥、生物菌肥等的配合使用，以滿足作物對營養的需求與土壤營養的補充。
下有機肥后死樹的部分原因肥有問題：
購買的商品有機肥原料低劣，如化工廠廢料、城市污泥、糖廠、造紙廠的各種下腳料、風化煤等，這些不僅養分含量不高，還可能存在重金屬、有害菌超標等風險，可能造成死樹；自制有機肥未徹底腐熟，在土壤中持續反應放熱燒根，可引起死樹。因此，在自己漚肥時，可添加活土君發酵王，發酵迅速且徹底。
施用時傷根：
有機肥一般是開溝下的，若開溝位置過于靠近主干，恐挖傷粗根，而這類根不像吸收根那么更迭較快，恢復起來需要較長的時間，果樹可能因樹勢急劇衰退而亡；除去直接挖斷粗根，開溝后未及時覆蓋，使根系長時間暴露在外，同樣會對樹體不利。
施用過量：
有機肥過量使用可能會導致燒根、土壤中磷、鉀等養分大量集聚，造成土壤養分不平衡；土壤中硝酸根離子集聚，致使作物硝酸根鹽超標，土壤溶液濃度高，不利于根系吸水等，最終引起死樹。